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Nature Commun. | 中國農科院果樹所發布高質量蘋果基因組,并揭示反轉錄轉座子和果實著色的關聯性

 

  2019年4月2日,中國農業科學院果樹研究所叢佩華研究員課題組在Nature Communications在線發表了題為A high-quality apple genome assembly reveals the association of a retrotransposon and red fruit colour的研究論文。該研究組裝了來源于花藥的蘋果純合系HFTH1的高質量基因組,并揭示了反轉錄轉座子和紅色果實顏色的關聯性。

  

  與'金帥'參考基因組相比,該研究在HFTH1基因組中鑒定到了18,047個缺失,12,101個插入和14個大的倒位。 研究發現,這些基因組變異主要是由轉座子引起的。 有意思的是,在花青素生物合成的關鍵轉錄因子MdMYB1上游有一個長末端重復(LTR)反轉錄轉座子的插入,與紅色果皮表型相關。

  

  Red phenotype of apple associated with an LTR retrotransposon

  總之,研究結果為蘋果紅色果實著色的分子機制提供了新的見解;該研究發布的高質量基因組為蘋果重要農業性狀的研究提供了重要基礎。

 

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